Il Manuale di Gestione del Protocollo Informatico deve essere predisposto dalle amministrazioni. All’interno del manuale devono essere riportati:
a) la pianificazione; b) il piano di sicurezza dei documenti informatici; c) le modalità di utilizzo di strumenti informatici per lo scambio di documenti; d) la descrizione del flusso di lavorazione dei documenti ricevuti, spediti o interni; e) l’indicazione delle regole di smistamento ed assegnazione dei documenti ricevuti; f) l’indicazione delle unità organizzative responsabili delle attività di registrazione di protocollo; g) l’elenco dei documenti esclusi dalla registrazione di protocollo; h) l’elenco dei documenti soggetti a registrazione particolare; i) il sistema di classificazione; j) le modalità di produzione e di conservazione delle registrazioni di protocollo informatico; k) la descrizione funzionale ed operativa del sistema di protocollo informatico; l) i criteri e le modalità per il rilascio delle abilitazioni di accesso interno ed esterno alle informazioni documentali; m) le modalità di utilizzo del registro di emergenza.
Il Centro di competenza sul protocollo informatico e la gestione elettronica dei documenti del CNIPA ha ultimato la redazione del modello di riferimento del Manuale di gestione utile a tutte le amministrazioni che realizzano progetti di gestione elettronica dei documenti. Tale documento fornisce alcune indicazioni operative per la stesura del Manuale di Gestione del Protocollo Informatico, dei documenti e dell’Archivio che le Pubbliche Amministrazioni, sono chiamate a predisporre ai sensi dell’art. 3, comma c) del DPCM 31 ottobre 2000 con le modalità riportate nel successivo art.5. "i Quaderni" n. 21 (febbraio 2006)